DNA亲和纯化测序（DAP-seq，DNA Affinity Purification sequencing），通过体外构建表达转录因子（TF，Transcription Factor）蛋白，与目标基因组片段结合，针对把目的蛋白所结合的基因组DNA片段进行富集。通过与高通量测序技术的结合，对DAP后的DNA产物进行测序分析，从全基因组范围内寻找目的蛋白的DNA结合位点，以高效率的测序手段得到高通量的数据结果。DAP能够有效解决CHIP技术缺乏目的蛋白特异性抗体的限制，适用范围更广。