蛋白鉴定,也称蛋白质全谱(shotgun)分析,指使用自下而上的蛋白质组学技术来研究复杂混合物中的所有蛋白质。研究对象可以是完整的机体、组织、细胞,体液或其提取物,其目的在于分析鉴定出尽可能多的多肽和蛋白质分子。